分子对接用于预测分子之间的相互作用，特别是小分子与蛋白质之间的结合方式。在生物化学和药物设计中，分子对接是一种重要的工具，用于研究药物与蛋白质的结合模式，寻找潜在的药物靶点，以及优化药物候选化合物。

分子对接的目标是预测小分子（如药物化合物）在蛋白质的结合口袋中的最佳位置和取向，以便能够形成稳定的结合复合物。在分子对接过程中，计算方法将考虑分子之间的静电相互作用、范德华力、氢键等相互作用力，以及蛋白质的构象灵活性。

分子对接技术在药物发现、生物分子的相互作用研究以及药物设计中有广泛的应用。它可以帮助科学家理解药物与蛋白质之间的相互作用机制，加速新药物的开发和优化，以及预测药物的活性和选择性。虽然分子对接是一个计算复杂度较高的过程，但由于它的高效性和可靠性，成为现代药物设计和分子生物学研究的重要手段之一。