25摄氏度下，对1:1.4:2比例的萘二磺酸-DMF-水玻璃态HOF材料（下称玻璃态HOF）进行建模、分子动力学模拟、数据分析、物理性质计算。

玻璃态物质的结构具有中近程有序、远程无序的特点。体现在模型当中，即是在小范围内，分子（原子团）之间的连接和相互作用具有典型特征，但在大范围上不具有重复性。因此，玻璃态物质的建模尺度应当足够，模拟时对相空间的采样也应尽可能充分。

建模时从三个方向出发同时构建初始构象：（1）从1:2:2比例的萘二磺酸-DMF-水晶体（下称晶体）结构出发，再随机抽取、移除30%的DMF分子，这样建得的初始构象，对于萘二磺酸和水而言仍然保持空间重复性，三种物质互相高度分散；（2）按随机算法向空间内投放1:1.4:2比例的萘二磺酸-DMF-水，该构象不具有空间重复性，三种物质较好地互相分散；（3）按照层状结构有规律地布置1:1.4:2比例的萘二磺酸-DMF-水，其中萘二磺酸和DMF以1-2 nm的高度分层布置，水均匀分散。

三种初始构象按相同的方法，分别进行能量最小化、0.5 ns的NpT系综压缩、2 ns的NVT系综模拟，最终达到的结构一致。该结构包含1440份1:1.4:2比例的萘二磺酸-DMF-水，共62464个原子，7.10×10⁵ Ǻ³体积，1.26×10³ kg/m³密度。